Alain Bauer est Professeur titulaire de la Chaire de Criminologie du Cnam depuis 2009, ainsi que Professeur associé à l’Université Fudan (Shanghai) et Senior Research Fellow au sein du Center of Terrorism du John Jay College of Criminal Justice à New York (Etats-Unis) et à l’Université de Droit et de Sciences Politiques de Chine (Beijing). Alain Bauer est également, depuis 2009, Président du Conseil Supérieur de la Formation et de la recherche Stratégiques (CSFRS) auprès du Président de la République et Directeur de la Chaire Sciences Policières et Criminelles du MBA Management de la Sécurité (Paris II, HEC, EOGN). Depuis 2012, il est aussi Président du Conseil National des Activités Privées de Sécurité (CNAPS), Éditeur de l’International Journal on Criminology. Il a par ailleurs été Président du conseil d'orientation de l'Observatoire National de la Délinquance (ONDRP) de 2003 à 2012, ainsi que Président du Groupe de travail puis du Groupe de contrôle sur les fichiers de police et de gendarmerie de 2006 à 2012. Parallèlement, il fut Rapporteur du Groupe de travail sur la police au quotidien en 2007, puis Président du Groupe de contrôle des fichiers des douanes en 2009, Président du Groupe de travail sur les fichiers judiciaires en 2010 et enfin Co-Président de la Mission sur le Livre Blanc de la Sécurité Publique en 2010 – 2011. Il a également été Administrateur de l'Institut des hautes études de sécurité intérieures (IHESI) devenu en 2004 l’Institut national des hautes études de sécurité (INHES), puis l’Institut national des hautes études de sécurité et de justice (INHES-J) jusqu’en avril 2016, et Administrateur de l’Institut des Hautes Etudes de la Défense Nationale de 2010 à 2016. Il a enfin été auditeur de l'IHESI. Anciennement, il fut Vice-président, chargé des affaires générales, administratives et financières de l'université Paris I-Panthéon Sorbonne (de 1982 à 1989), Membre du conseil de la Chancellerie des universités de Paris (de 1983 à 1988), et a été Chargé de mission auprès du directeur de cabinet du Premier ministre Michel Rocard (de 1988 à 1990).
